在宅基地合作协议建设无效的情况下，法院为何

法院可能基于特定情况判决有效。依据《相关法律法规》，若合同无效双方均有过错，损失应共担。不及时处理可能导致权益受损，如宅基地被非法占用。
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协议无效法院却判决有效，需分析。操作如下：1.审查合同无效原因，如违反法律或双方过错；2.若合同确无效，与对方协商损失分担；3.协商不成，提起诉讼，请求法院依据《相关法律法规》公正裁决。
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处理此类问题常见方式为协商、诉讼。协商不成时，应选择诉讼途径，依据法律规定维护自身权益，确保合法处理宅基地问题。